O meu primeiro amor. Apaixonei-me pelos dispositivos Oxford Nanopore, especialmente o muito versátil MK1B, durante a minha tese de mestrado em nano-biofísica e, desde então, tenho visto tanto potencial a ganhar vida com estes pequenos dispositivos versáteis. Quer esteja no terreno, longe dos grandes laboratórios, ou queira fazer algo completamente alucinante para a sua pergunta, este pequeno dispositivo é perfeito para investigadores individuais, pequenos projectos de investigação ou projectos paralelos com um orçamento apertado. É simplesmente uma óptima opção. No entanto, enquanto estava a escrever a minha tese, nem tudo funcionou como esperado, o que não é uma surpresa. Estando completamente concentrado em pôr as coisas a funcionar (aka Tese de Mestrado...) comecei a otimizar as coisas ao nível do fluxo de trabalho e do software, especialmente na API aberta de amostragem adaptativa.
Desde esse dia inicial, avançamos rapidamente até hoje: a minha equipa e eu criámos algo a que chamamos orgulhosamente "DNA ME Cloud Anchor".
Resumidamente, limitamo-nos a controlar remotamente um dispositivo Oxford Nanopore MK1D através do seu motor de software/API oficialmente suportado e, em seguida, criamos o nosso próprio tipo de pequena solução que pode emular qualquer tipo de kit químico existente (e muito mais) a nível digital; e não precisamos da enorme potência da GPU normalmente envolvida. Pode imaginar-se o Cloud Anchor como um "controlo remoto turbinado" (com alguma magia de IA no interior) para os dispositivos Oxford Nanopore.
Ao utilizar o nosso pequeno toque extra, os nossos clientes passam agora de resultados "(muito) bons" para resultados "extremamente excelentes" na sua viagem da "Amostra à Resposta".
Envie-me o seu problema mais doloroso de DNA wet-lab to Data, vamos ver COMO (e não "SE") a minha equipa e eu vamos resolvê-lo para si.
Sinceramente,
Evgenii Varlygin DIRECTOR EXECUTIVO