אהבתי הראשונה. התאהבתי במכשירי Oxford Nanopore, במיוחד ב-MK1B הרב-תכליתי, במהלך כתיבת תזת המאסטר שלי בננו-ביופיזיקה, ומאז אני רואה פוטנציאל עצום במכשירים הקטנים והרב-תכליתיים האלה. בין אם אתם עובדים בשטח, רחוק ממעבדות גדולות, או רוצים לבצע מחקר מאתגר במיוחד, המכשיר הקטן הזה מושלם לחוקרים בודדים, לפרויקטי מחקר קטנים או לפרויקטים צדדיים עם תקציב מוגבל. הוא פשוט מתאים בצורה מושלמת. עם זאת, בזמן כתיבת התזה שלי, לא הכל עבד כפי שציפיתי, מה שלא הפתיע אותי. כשהייתי ממוקד לחלוטין בהפעלת המכשיר (כלומר, בתזה לתואר שני...), התחלתי לייעל את תהליך העבודה ואת התוכנה, במיוחד את ה-API הפתוח לדגימה אדפטיבית. מהימים ההם ועד היום: הצוות שלי ואני פיתחנו משהו שאנו גאים לקרוא לו "DNA ME Cloud Anchor".
בקיצור, אנחנו פשוט שולטים מרחוק במכשיר Oxford Nanopore MK1D באמצעות מנוע התוכנה/API הנתמך רשמית, ואז אנחנו מחברים את הכלים שלנו לכדי פתרון קטן שיכול לחקות כל סוג של ערכת כימיקלים קיימת (ועוד הרבה יותר) ברמה הדיגיטלית; ואנחנו לא צריכים את כוח ה-GPU העצום שנדרש בדרך כלל. אפשר לדמיין את Cloud Anchor כמעין "שלט רחוק טורבו" (עם קצת קסם AI בפנים) למכשירי Oxford Nanopore. באמצעות השינוי הקטן שהוספנו, הלקוחות שלנו עוברים כעת מ"תוצאות (טובות מאוד)" ל"תוצאות מצוינות במיוחד" במסעם מ"הדגימה לתשובה".
שלחו לי את הבעיה הכואבת ביותר שלכם בתחום ה-DNA, ונראה איך (לא "אם") הצוות שלי ואני נפתור אותה עבורכם. בכבוד רב, Evgenii Varlygin מנכ"ל