Η πρώτη μου αγάπη. Ερωτεύτηκα τις συσκευές Oxford Nanopore, ειδικά την πολύ ευέλικτη MK1B κατά τη διάρκεια της μεταπτυχιακής μου διατριβής στη νανο-βιοφυσική και από τότε έχω δει τόσες πολλές δυνατότητες να αξιοποιούνται με αυτές τις μικρές ευέλικτες συσκευές. Είτε αν βρίσκεστε στο πεδίο, μακριά από μεγάλα εργαστήρια, είτε αν θέλετε να τρέξετε κάτι εντελώς εγκεφαλικό για το ερώτημά σας, αυτή η μικρή συσκευή είναι ιδανική για μεμονωμένους ερευνητές, μικρά ερευνητικά έργα ή παράπλευρα έργα με περιορισμένο προϋπολογισμό. Είναι απλά μια εξαιρετική λύση. Ωστόσο, κατά τη διάρκεια της συγγραφής της διατριβής μου δεν λειτούργησαν πραγματικά όλα όπως αναμενόταν, δεν αποτελεί έκπληξη εδώ. Όντας εντελώς προσηλωμένος στο να βάλω τα πράγματα σε λειτουργία (aka Master Thesis...) άρχισα να βελτιστοποιώ πράγματα σε επίπεδο ροής εργασίας και λογισμικού, ειδικά στο ανοιχτό API προσαρμοστικής δειγματοληψίας.
Από αυτή την πρώιμη ημέρα, γρήγορα προς τα εμπρός μέχρι σήμερα : Η ομάδα μου και εγώ καταλήξαμε σε κάτι που με υπερηφάνεια αποκαλούμε "DNA ME Cloud Anchor".
Με λίγα λόγια, απλά ελέγχουμε εξ αποστάσεως μια συσκευή Oxford Nanopore MK1D μέσω της επίσημα υποστηριζόμενης μηχανής λογισμικού/API και στη συνέχεια δημιουργούμε τη δική μας μικρή λύση που μπορεί να μιμηθεί κάθε είδους υπάρχον χημικό κιτ (και πολλά άλλα) σε ψηφιακό επίπεδο και δεν χρειαζόμαστε την τεράστια ισχύ GPU που συνήθως απαιτείται. Μπορείτε να φανταστείτε το Cloud Anchor να είναι κάτι σαν ένα "υπερτροφοδοτούμενο τηλεχειριστήριο" (με κάποια μαγική τεχνητή νοημοσύνη στο εσωτερικό του) για τις συσκευές Oxford Nanopore Devices.
Με τη χρήση της μικρής μας έξτρα συστροφής, οι πελάτες μας πηγαίνουν τώρα από τα ήδη "(πολύ) καλά αποτελέσματα" στα "εξαιρετικά άριστα" αποτελέσματα στο ταξίδι τους από το "Δείγμα στην Απάντηση".
Στείλτε μου το πιο οδυνηρό σας πρόβλημα "από το υγρό εργαστήριο DNA στα δεδομένα", για να δούμε ΠΩΣ (όχι "ΑΝ") η ομάδα μου και εγώ θα το λύσουμε για εσάς.
Ειλικρινά δικός σας,
Evgenii Varlygin ΔΙΕΥΘΎΝΩΝ ΣΎΜΒΟΥΛΟΣ