ఫార్మాజెనోమిక్స్ అర్ధమవుతుంది-అయితే ఫార్మా వాస్తవానికి దానిని ఎందుకు ఉపయోగించడం లేదు? ఫార్మాజెనోమిక్స్ (పిజిఎక్స్) అసాధారణ పారడాక్స్కు చేరుకుంది. శాస్త్రీయ ఆధారాలు పరిపక్వంగా ఉన్నాయి, క్లినికల్ (మరియు ఆర్థిక) ప్రయోజనాలు నిస్సందేహంగా ఉన్నాయి, అయినప్పటికీ ఆమోదం నెమ్మదిగా, విచ్ఛిన్నంగా మరియు అసమానంగా ఉంది. ముఖ్యంగా క్లినికల్ ట్రయల్స్లో, ఫార్మాజెనోమిక్ ప్రొఫైలింగ్ అరుదుగా ఉపయోగించబడుతుంది. ClinicalTrials.gov స్కాన్ మొత్తం 350,728 (~0.18%) లో 619 PGx-సంబంధిత ఇంటర్వెన్షనల్ ట్రయల్స్ మాత్రమే గుర్తించింది మరియు విచారణలో PGx అనేక చాలా ఆచరణాత్మక పనులు చేయగలిగినప్పటికీ, సగం కంటే తక్కువ స్పష్టంగా ఏ జన్యువులను అధ్యయనం చేస్తున్నారో పేర్కొనబడింది: క్లీనర్ ఎఫెక్టివిటీ సిగ్నల్: తక్కువ వైవిధ్యం -> స్పష్టమైన ప్రతిస్పందనదారు/ప్రతిస్పందించని కథ తక్కువ భద్రతా సంఘటనలు: అధిక ప్రమాదం ఉన్న జన్యురూపాలను ముందుగానే గుర్తించడం -> తక్కువ నివారించదగిన ఎడిఆర్లు విచారణలో తక్కువ ఘర్షణ: తక్కువ విరామాలు, తక్కువ రక్షణ మందులు, తక్కువ "అగ్ని అభ్యాసాలు" ప్రారంభ దశలో మెరుగైన మోతాదు వ్యూహం: పి.జి.ఎక్స్. పి.కె./పిడి అవుట్లైయర్లు డోస్-పరిమితి అయ్యే ముందు వాటిని వివరించడానికి సహాయపడుతుంది.విషపూరితం ముగింపు రేఖ వద్ద బలమైన కథనం: సంభావ్యంగా నిర్వచించబడిన ఉప సమూహాలు -> చెల్లింపుదారుల కోసం మరింత రక్షణాత్మక లేబుల్ వ్యూహం చాలా వరకు అభివృద్ధి బృందాలకు, PGx ఇప్పటికీ స్పష్టంగా ప్రమాదాన్ని తగ్గించకుండా సంక్లిష్టతను జోడించేదిగా అనిపిస్తుంది: మరిన్ని పరీక్షలు, మరిన్ని సమన్వయం, మరిన్ని నియంత్రణ ప్రశ్నలు, మరిన్ని విషయాలు తప్పు కావచ్చు. కాలక్రమాలు కఠినంగా ఉండి, వైఫల్యం ఖరీదుతో కూడుకున్నప్పుడు, వైద్యపరంగా సంబంధితమైనదైనా, మరొక కదిలే భాగాన్ని ప్రవేశపెట్టకుండా, సరళీకరించడం అనేది స్వభావం. అందుకే క్లినికల్ ట్రయల్స్లో "మంచి ఆలోచన" నుండి "డిఫాల్ట్ ఇన్ఫ్రాస్ట్రక్చర్" కు వెళ్లడానికి PGx కష్టపడింది. వైద్యుడి అనుభవం నివేదికలు కూడా వాణిజ్య PGx ప్యానెల్లు CPIC/FDA/DPWG మార్గదర్శకాల ద్వారా నిర్వచించబడిన కీలక చర్య తీసుకోగల జన్యువులను కోల్పోవచ్చని పేర్కొన్నాయి, తక్కువ-సాక్ష్యం వేరియంట్లను చేర్చడం వలన వాస్తవానికి ఆ ఫలితాలు ఆచరణలో ఉపయోగకరంగా ఉన్నాయో లేదో తెలుసుకోవడం కష్టతరం అవుతుంది. సంబంధిత జన్యువు చేర్చబడినప్పటికీ, ప్యానెల్లు స్థిరంగా వైద్యపరంగా చర్య చేయగల అన్నింటిని సంగ్రహించకపోవచ్చు.యుగ్మవికల్పాలు (కాపీ సంఖ్య వైవిధ్యాలు లేదా హైబ్రిడ్ నిర్మాణాలు వంటివి), ఇవి పాల్గొనేవారిలో జీవక్రియ తప్పుడు వర్గీకరణకు దారితీయవచ్చు. పిజిఎక్స్ పరీక్షను ఉపయోగించినప్పటికీ, ఇది కఠినమైన ట్రయల్ టైమ్ లైన్లలో సరిపోలాలి: క్లినికల్గా సంబంధిత ఉండటానికి ~7 రోజుల్లోపు ఫలితాలను తిరిగి ఇవ్వాల్సిన అవసరం ఉన్న ప్రిపరే వంటి ప్రోగ్రామ్లు, మరియు వాస్తవ ప్రపంచ అమరికలలో PGx ని మోహరించడంలో జన్యు ఎంపిక మరియు ఫినోటైప్ అనువాదం నుండి రిపోర్టింగ్, సిడిఎస్ లాజిక్ మరియు ఇహెచ్ఆర్ ఇంటిగ్రేషన్ వరకు బహుళ జట్లలో ప్రతిదీ ఉంటుంది. ఆచరణలో, క్రమ క్రమ డేటాను మార్గదర్శక-సమలేఖన ఫినోటైప్లుగా మార్చడం తరచుగా ప్రత్యేక బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ పైప్లైన్లు మరియు స్థానిక మౌలిక సదుపాయాలపై ఆధారపడి ఉంటుంది, ఇది సైట్ల మధ్య జాప్యాలు, వివరణ సవాళ్లు మరియు వైవిధ్యాన్ని పరిచయం చేస్తుంది, వైద్యులు నిరంతరం సమయ పరిమితులు మరియు సంక్లిష్ట ఫలిత వివరణను ప్రధాన అడ్డంకులుగా పేర్కొంటారు. వ్యావసాయిక జన్యుశాస్త్రం కోసం అత్యంత బలమైన వాదన ఇప్పటికే చేయబడిందనేది వ్యంగ్యం. ప్రిపరే స్టడీ చూపించింది, ముందస్తు పిజిఎక్స్వైద్యపరంగా సంబంధిత ప్రతికూల ఔషధ ప్రతిచర్యలను సుమారు 30 శాతం తగ్గిస్తుంది. అది స్వల్ప శాతం కాదు. సాధారణంగా ఫార్మా రంగం ఆ విధమైన ప్రభావ పరిమాణాన్ని జరుపుకుంటుంది. కానీ PREPARE కూడా PGx ఇంకా ఎందుకు స్కేల్ చేయలేదని నిశ్శబ్దంగా చూపించింది: కేంద్రీకృత జన్యురూపం, బహుళ-రోజుల టర్నరౌండ్ సమయాలు, భారీ సమన్వయం, డేటా ప్రాసెసింగ్ ఓవర్ హెడ్ మరియు ప్రపంచ, వేగవంతమైన విచారణల కోసం ఎప్పుడూ రూపొందించబడని ప్యానెల్లు. మరో మాటలో చెప్పాలంటే, జీవశాస్త్రం పనిచేసింది. రవాణా సదుపాయం లేకపోయింది. ఇక్కడే డిఎన్ఎ ఎంఈ వస్తుంది. డీఎన్ఏ ఎంఈ వద్ద, మేము సమర్థవంతమైన, సరళీకృత సాఫ్ట్వేర్ పరిష్కారంతో నానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్ చుట్టూ ఫార్మాజెనోమిక్స్ను చేరుకుంటున్నాము, ఎందుకంటే ఆ కలయిక చివరకు ట్రయల్స్ వాస్తవానికి ఎలా పనిచేస్తాయో దానితో పిజిఎక్స్ను అనుకూలంగా చేస్తుంది. నానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్ మీరు నమూనాలను కేంద్రీకృత ప్రయోగశాలకు రవాణా చేయడానికి బదులుగా విచారణ స్థలానికి దగ్గరగా జన్యు డేటాను ఉత్పత్తి చేయడానికి అనుమతిస్తుంది. మరింత ముఖ్యంగా, లాంగ్రీడ్ సీక్వెన్సింగ్ అనేది ఊహాజనిత మరియు తప్పుడు వర్గీకరణ లేకుండా (సివైపి2డి6 వంటివి) ముఖ్యమైన ఔషధ జన్యువులను పరిష్కరిస్తుంది.ప్లేగు సాంప్రదాయ చిన్న-వ్రాసిన ప్యానెల్లు. కానీ క్రమబద్ధీకరణ అనేది కథలో సగం మాత్రమే. డేటా ఉత్పత్తి అయిన తర్వాత ఏమి జరుగుతుందనేది నిజమైన అన్లాక్. డీఎన్ఏ ఎంఈ ముడి రీడ్లను ప్రామాణిక ఔషధ జన్యుపరమైన అవుట్పుట్లుగా మారుస్తుంది, ఇవి యంత్ర-చదవగలిగేవి మరియు ట్రయల్-రెడీ, బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ నిపుణులు క్రమాంకన ఫలితాలకు చేరుకోవాల్సిన అవసరం లేకుండా. డేటా నేరుగా భద్రతా పర్యవేక్షణ, మోతాదు పెంపు నియమాలు లేదా అనుకూల విచారణ తర్కంలోకి ప్రవహించవచ్చు. విశ్లేషణలను ప్రాథమిక ల్యాప్టాప్లో స్థానికంగా కూడా అమలు చేయవచ్చు; జీపీయూలు లేదా ఖరీదైన కంప్యూటేషనల్ పరికరాలు అవసరం లేదు, మరియు సున్నితమైన పాల్గొనే జన్యు డేటాను అప్లోడ్ చేయడం లేదా పంపించాల్సిన అవసరం లేదు. డిఎన్ఎ ఎంఈ యొక్క నానోపోర్ ఆధారిత వర్క్ఫ్లో సిపిజి మిథైలేషన్ మరియు యుగ్మవికల్ప-నిర్దిష్ట మిథైలేషన్ను నేరుగా అదే క్రమాంకనం పరుగు నుండి గుర్తించగలదు, అదనపు పరీక్షలు లేదా డౌన్స్ట్రీమ్ ప్రాసెసింగ్ లేకుండా ఫార్మాజెనోమిక్ ప్రొఫైలింగ్కు క్రియాత్మక పొరను జోడిస్తుంది. ఇది పాల్గొనేవారిని గుర్తించడానికి వీలు కల్పిస్తుంది, వారి వాస్తవ ప్రపంచ జీవక్రియ వారి అంచనా వేసిన జీవక్రియ నుండి భిన్నంగా ఉండవచ్చు.ఫార్మాజెన్ల యొక్క ఎపిజెనెటిక్ నియంత్రణ కారణంగా జన్యురూపం, అవుట్లీయర్లకు గురికావడాన్ని తగ్గించడానికి మరియు అదే క్రమబద్ధీకరించబడిన పైప్లైన్లో మెటాబోలైజర్ వర్గీకరణను మెరుగుపరచడంలో సహాయపడుతుంది. పిజిఎక్స్ వేగవంతమైనది, సరసమైనదిగా మరియు కార్యాచరణపరంగా అదృశ్యమైన (PK నమూనా లేదా భద్రతా ప్రయోగశాలల మాదిరిగానే పొందుపరచబడినది) అయిన వెంటనే, ఫార్మా అది విలువైనదా అని అడగడం మానేస్తుంది. వారు అలా చేయకపోవడంలోని ప్రమాదాన్ని ఎందుకు అంగీకరిస్తారనే ప్రశ్న తలెత్తుతుంది. మీరు PGx ని ట్రయల్లో విలీనం చేయడానికి ప్రయత్నించినట్లయితే, ఖర్చు, టర్నరౌండ్ సమయం, కార్యకలాపాలు లేదా అంతర్గత కొనుగోలు అనేది అతిపెద్ద అడ్డంకిగా ఉందా? జట్లు అడవిలో ఏమి చూస్తున్నాయో తెలుసుకోవాలని మాకు ఆసక్తిగా ఉంది. (మరియు మీరు మీ ఆస్తులకు అనుగుణంగా ట్రయల్ రెడీ ప్యానెల్ + ప్లగ్అండ్ప్లే నానోపోర్ వర్క్ఫ్లో కావాలనుకుంటే, DNA ME వద్ద మాకు సందేశాన్ని పంపండి మరియు మేము మీతో కలిసి దీన్ని నిర్మిస్తాము.)