เภสัชพันธุศาสตร์มีเหตุผล — แล้วทำไมบริษัทยาถึงไม่ใช้จริง?

เภสัชพันธุศาสตร์มีความสมเหตุสมผล — แล้วทำไมบริษัทยาถึงไม่ใช้มันจริง ๆ?

เภสัชพันธุศาสตร์ (PGx) ได้มาถึงจุดที่ขัดแย้งอย่างไม่คาดคิด หลักฐานทางวิทยาศาสตร์มีความสมบูรณ์แล้ว ประโยชน์ทางคลินิก (และเศรษฐกิจ) นั้นไม่อาจปฏิเสธได้ แต่การนำมาใช้ยังคงช้า กระจายตัวอย่างไม่สม่ำเสมอ และไม่เท่าเทียม
 

โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการทดลองทางคลินิก การทำโปรไฟล์ทางเภสัชพันธุศาสตร์แทบจะไม่เคยถูกนำมาใช้เลย จากการสแกน ClinicalTrials.gov พบว่ามีการทดลองเชิงแทรกแซงที่เกี่ยวข้องกับ PGx เพียง 619 การทดลองจากทั้งหมด 350,728 การทดลอง (~0.18%) และมีน้อยกว่าครึ่งที่ระบุอย่างชัดเจนว่ากำลังศึกษาเกี่ยวกับยีนใดบ้าง ทั้งที่ PGx ในการทดลองสามารถทำสิ่งที่เป็นประโยชน์ในทางปฏิบัติได้หลายอย่าง:
 

สัญญาณประสิทธิภาพของยาทำความสะอาดที่ชัดเจนขึ้น: ความแปรปรวนน้อยลง -> เรื่องราวของผู้ตอบสนอง/ผู้ไม่ตอบสนองที่
ชัดเจนยิ่งขึ้น เหตุการณ์ด้านความปลอดภัยน้อยลง: ระบุพันธุกรรมที่มีความเสี่ยงสูงได้ตั้งแต่เนิ่นๆ -> ลดเหตุการณ์ไม่พึงประสงค์จากการใช้ยา (ADR) ที่หลีกเลี่ยงได้
ความยุ่งยากในการทดลองลดลง: การหยุดใช้ยา น้อยลง การใช้ยาช่วยน้อยลง การดำเนินการ
ฉุกเฉินน้อยลง กลยุทธ์การให้ยาที่ดีขึ้นในระยะเริ่มต้น: PGx ช่วยอธิบายค่า PK/PD ที่ผิดปกติก่อนที่มันจะกลายเป็นความประหลาดใจของความเป็นพิษที่จำกัด
ขนาดยา เรื่องราวที่แข็งแกร่งยิ่งขึ้นเมื่อถึงเส้นชัย: กลุ่มย่อยที่กำหนดล่วงหน้า -> กลยุทธ์การกำหนดฉลากที่ยืนยันได้มากขึ้นสำหรับผู้จ่ายเงิน
 

สำหรับทีมพัฒนาส่วนใหญ่ PGx ยังคงรู้สึกเหมือนเป็นสิ่งที่เพิ่มความซับซ้อนโดยไม่ลดความเสี่ยงอย่างชัดเจน: การทดสอบมากขึ้น การประสานงานมากขึ้น คำถามด้านกฎระเบียบมากขึ้น สิ่งที่อาจผิดพลาดมากขึ้น เมื่อกรอบเวลาจำกัดและความล้มเหลวมีค่าใช้จ่ายสูง สัญชาตญาณคือการทำให้เรียบง่าย ไม่ใช่เพิ่มส่วนที่เคลื่อนไหวอีก แม้ส่วนนั้นจะมีความเกี่ยวข้องทางการแพทย์ก็ตาม นั่นคือเหตุผลที่ PGx ประสบปัญหาในการก้าวจาก "แนวคิดที่ดี" ไปสู่ "โครงสร้างพื้นฐานมาตรฐาน" ในการทดลองทางคลินิก
รายงานประสบการณ์จากแพทย์ยังระบุด้วยว่า ชุดตรวจ PGx เชิงพาณิชย์อาจพลาดยีนสำคัญที่สามารถนำไปใช้ได้จริงตามที่แนะนำโดยแนวทางของ CPIC/FDA/DPWG ในขณะที่รวมตัวแปรที่มีหลักฐานต่ำ ทำให้ยากต่อการทราบว่าผลลัพธ์ใดมีประโยชน์จริงในทางปฏิบัติ แม้ว่าจะรวมยีนที่เกี่ยวข้องแล้ว ชุดตรวจอาจไม่สามารถจับคู่ได้ครบถ้วนกับทุกอัลลีลที่สามารถนำไปใช้ได้ทางคลินิก (เช่น ตัวแปรจำนวนสำเนาหรือโครงสร้างไฮบริด) ซึ่งอาจนำไปสู่การจำแนกประเภทของผู้เข้าร่วมผิดในกระบวนการเมตาบอลิซึม
 

แม้ว่าจะมีการใช้การทดสอบ PGx แต่ก็ต้องเข้ากับกรอบเวลาที่จำกัดของการทดลอง: โปรแกรมเช่น PREPARE ต้องการให้ผลลัพธ์กลับมาภายในประมาณ 7 วันเพื่อให้มีความเกี่ยวข้องทางคลินิก และในสภาพแวดล้อมจริง การนำ PGx ไปใช้เกี่ยวข้องกับทุกสิ่งตั้งแต่การเลือกยีนและการแปลลักษณะทางฟีโนไทป์ไปจนถึงการรายงาน, ตรรกะ CDS และการบูรณาการ EHR ในหลายทีม ในทางปฏิบัติ การแปลงข้อมูลลำดับพันธุกรรมให้เป็นลักษณะทางฟีโนไทป์ที่สอดคล้องกับแนวทางปฏิบัติ มักต้องอาศัยกระบวนการชีวสารสนเทศเฉพาะทางและโครงสร้างพื้นฐานในท้องถิ่น ซึ่งก่อให้เกิดความล่าช้า ความท้าทายในการตีความ และความแปรปรวนระหว่างแต่ละสถานที่ โดยแพทย์มักอ้างถึงข้อจำกัดด้านเวลาและความซับซ้อนในการแปลผลว่าเป็นอุปสรรคสำคัญ
 

ความย้อนแย้งก็คือ ข้อโต้แย้งที่หนักแน่นที่สุดสำหรับเภสัชพันธุศาสตร์ได้ถูกนำเสนอไปแล้ว การศึกษา PREPARE แสดงให้เห็นว่าการใช้ PGx ล่วงหน้าเพื่อป้องกันสามารถลดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ของยาที่เกี่ยวข้องกับคลินิกได้ประมาณ 30% นั่นไม่ใช่เรื่องเล็กน้อย นั่นคือขนาดของผลลัพธ์ที่บริษัทยาทั่วไปมักจะเฉลิมฉลอง
 

แต่ PREPARE ก็ได้แสดงให้เห็นอย่างเงียบๆ ว่าทำไม PGx ยังไม่สามารถขยายขนาดได้: การตรวจพันธุกรรมแบบรวมศูนย์, ระยะเวลาการดำเนินการหลายวัน, การประสานงานที่ซับซ้อน, ภาระงานในการประมวลผลข้อมูล, และชุดการทดสอบที่ไม่เคยถูกออกแบบมาสำหรับการทดลองระดับโลกที่เคลื่อนไหวอย่างรวดเร็ว
กล่าวอีกนัยหนึ่งคือ ชีววิทยาทำงานได้ แต่การจัดการด้านโลจิสติกส์ไม่รองรับ
นี่คือจุดที่ DNA ME เข้ามาช่วย
ที่ DNA ME เรากำลังนำแนวทางด้านเภสัชพันธุศาสตร์มาประยุกต์ใช้กับการหาลำดับพันธุกรรมแบบนาโนพอร์ด้วยซอฟต์แวร์ที่มีประสิทธิภาพและใช้งานง่าย เพราะการผสมผสานนี้ทำให้ PGx สามารถใช้งานได้จริงกับการทดลองทางคลินิกในปัจจุบัน
 

การหาลำดับพันธุกรรมแบบนาโนพอร์ช่วยให้คุณสามารถสร้างข้อมูลทางพันธุกรรมได้ใกล้กับสถานที่ทดลองแทนที่จะต้องส่งตัวอย่างไปยังห้องปฏิบัติการกลางที่ตั้งอยู่ไกล ที่สำคัญกว่าคือ การหาลำดับแบบอ่านยาวสามารถแก้ไขปัญหาของยีนทางเภสัชพันธุกรรมที่มีความสำคัญที่สุด (เช่น CYP2D6) ได้โดยไม่ต้องพึ่งพาการคาดเดาและการจำแนกผิดพลาดที่มักเกิดขึ้นกับแบบอ่านสั้นแบบดั้งเดิม

แผง. แต่การจัดลำดับเป็นเพียงครึ่งหนึ่งของเรื่องราว. สิ่งที่แท้จริงคือการปลดล็อกคือสิ่งที่เกิดขึ้นหลังจากข้อมูลถูกสร้างขึ้น.
 

DNA ME เปลี่ยนข้อมูลดิบจากการอ่านลำดับพันธุกรรมให้เป็นผลลัพธ์ทางเภสัชพันธุศาสตร์มาตรฐานที่เครื่องจักรสามารถอ่านได้และพร้อมสำหรับการทดลอง โดยไม่จำเป็นต้องมีผู้เชี่ยวชาญด้านชีวสารสนเทศในการเข้าถึงผลลัพธ์การถอดรหัส ข้อมูลสามารถไหลเข้าสู่ระบบการติดตามความปลอดภัย กฎการเพิ่มขนาดยา หรือตรรกะการทดลองแบบปรับเปลี่ยนได้โดยตรง การวิเคราะห์ยังสามารถดำเนินการบนแล็ปท็อปพื้นฐานได้โดยไม่ต้องใช้ GPU หรืออุปกรณ์คอมพิวเตอร์ราคาแพง และไม่ต้องอัปโหลดหรือส่งข้อมูลพันธุกรรมที่ละเอียดอ่อนของผู้เข้าร่วมการทดลอง
 

กระบวนการทำงานที่ใช้เทคโนโลยีนาโนพอร์ของ DNA ME สามารถตรวจจับการเมทิลเลชันของ CpG และการเมทิลเลชันเฉพาะอัลลีลได้โดยตรงจากการวิ่งซีเควนซ์เดียวกัน เพิ่มชั้นการทำงานเชิงฟังก์ชันให้กับการวิเคราะห์ทางเภสัชพันธุศาสตร์โดยไม่ต้องใช้การทดสอบเพิ่มเติมหรือการประมวลผลขั้นต่อไป ซึ่งช่วยให้สามารถระบุผู้เข้าร่วมการทดลองที่การเผาผลาญจริงอาจแตกต่างจากจีโนไทป์ที่คาดการณ์ไว้เนื่องจากการควบคุมทางอีพิเจเนติกของยีนทางเภสัชวิทยา ช่วยลดการสัมผัสยาที่ผิดปกติและปรับปรุงการจำแนกประเภทของผู้เผาผลาญยาภายในกระบวนการที่ราบรื่นเดียวกัน
 

เมื่อ PGx กลายเป็นสิ่งที่รวดเร็ว ราคาไม่แพง และไม่ปรากฏในกระบวนการดำเนินงาน (ฝังตัวอยู่ในระบบเช่นเดียวกับตัวอย่าง PK หรือการตรวจสอบความปลอดภัยในห้องปฏิบัติการ) บริษัทยาจะหยุดถามว่ามีคุณค่าที่จะทำหรือไม่ คำถามคือทำไมพวกเขาถึงยอมรับความเสี่ยงที่จะไม่ทำมัน

ถ้าคุณเคยพยายามรวม PGx เข้ากับการทดลองอะไร สิ่งที่ขัดขวางมากที่สุดคืออะไร: ค่าใช้จ่าย, เวลาในการดำเนินการ, การดำเนินงาน, หรือการยอมรับภายในองค์กร?

เราอยากรู้ว่าทีมต่างๆ เห็นอะไรในสถานการณ์จริง (

และถ้าคุณต้องการแผงตรวจที่พร้อมสำหรับการทดลอง + กระบวนการทำงานแบบ plug-and-play ที่ปรับให้เข้ากับสินทรัพย์ของคุณ ส่งข้อความหาเราที่ DNA ME แล้วเราจะสร้างมันร่วมกับคุณ)